硼中子俘獲治療BNCT不適用于對硼元素吸收率低的惡性腫瘤、缺乏明確腫瘤邊界的彌漫性癌癥、已發生全身廣泛轉移的晚期腫瘤、血腦屏障完整的顱內腫瘤以及快速增殖型未分化癌。

部分惡性腫瘤細胞膜表面硼載體蛋白表達不足，導致硼-10化合物無法有效富集。這類腫瘤包括某些低分化腺癌、肉瘤亞型，治療前需通過PET-CT或生物標記物檢測確認硼攝取率。

胰腺癌、膠質母細胞瘤等呈浸潤性生長的腫瘤，由于與正常組織分界模糊，中子束難以精準定位。這類腫瘤可能伴隨神經血管侵犯癥狀，傳統放療聯合替莫唑胺仍是主要方案。

已發生骨、肝等多器官轉移的IV期腫瘤，BNCT僅能局部控制原發灶。乳腺癌轉移癌可能出現病理性骨折、黃疸等全身癥狀，需采用帕博利珠單抗等全身治療方案。

原發性中樞神經系統淋巴瘤等受血腦屏障保護，硼藥難以穿透。這類腫瘤通常表現為顱內壓增高，需通過甲氨蝶呤鞘內注射聯合全腦放療控制。

小細胞肺癌、尤文氏肉瘤等倍增時間短于72小時的腫瘤，在硼藥富集完成前已發生增殖。這類癌癥可能伴隨副腫瘤綜合征，推薦依托泊苷聯合鉑類化療。

BNCT適用性評估需結合腫瘤生物學特性與影像學檢查，非適應癥患者可選擇質子治療或免疫檢查點抑制劑。日常護理需保證每日30分鐘有氧運動及足量優質蛋白攝入，定期監測血常規與腫瘤標志物，避免高糖飲食刺激腫瘤代謝。