乳糖不耐受可通過調整喂養方式、補充乳糖酶、選擇低乳糖配方奶等方式處理，通常由先天性乳糖酶缺乏、繼發性腸黏膜損傷、早產兒發育不全、基因遺傳、腸道菌群失衡等原因引起。
母乳喂養前15分鐘口服乳糖酶制劑，或將母乳與無乳糖配方奶混合喂養。少量多次哺乳可減輕腸道負擔，單次哺乳量控制在60-90ml，間隔2-3小時喂養。
選擇含β-半乳糖苷酶的制劑，如Lactaid、Colief、Kerulac。酶制劑需在每次哺乳前添加至母乳中，37℃靜置15分鐘使乳糖充分分解。注意觀察是否出現皮疹等過敏反應。
重度不耐受者可選用低乳糖配方奶含乳糖≤2g/100ml或深度水解配方。大豆配方奶需謹慎使用，可能引發交叉過敏。替代喂養期間需監測體重增長曲線。
繼發性不耐受可能與輪狀病毒感染、克羅恩病等因素有關，通常表現為水樣便、腸鳴音亢進等癥狀。急性期可采用無乳糖飲食，原發病控制后逐步恢復母乳。
補充鼠李糖乳桿菌GG株、布拉氏酵母菌等益生菌。避免使用抑制腸黏膜修復的藥物，如非甾體抗炎藥。母親飲食減少奶制品攝入可降低母乳乳糖濃度。
哺乳期母親需保持鈣質攝入，每日食用豆腐、深綠色蔬菜、無乳糖酸奶等替代乳制品。嬰兒可進行被動操促進腸道蠕動，撫觸腹部時順時針方向按摩。定期檢測尿半乳糖濃度評估耐受情況，生長發育遲緩需及時就診。母乳中的免疫球蛋白和低聚糖對腸道菌群建立具有不可替代作用，非必要不建議完全停喂。
