腸道菌群失調可通過益生菌制劑、抗生素調節、益生元補充、中藥調理、糞菌移植等方式治療。腸道菌群失調通常由飲食結構失衡、長期使用抗生素、慢性腸道疾病、免疫功能障礙、精神壓力過大等原因引起。
雙歧桿菌三聯活菌、酪酸梭菌活菌、地衣芽孢桿菌等益生菌可直接補充腸道有益菌群。這類藥物適用于輕中度菌群失調，能競爭性抑制致病菌定植，改善腹瀉、腹脹癥狀。需冷藏保存并與抗生素間隔2小時服用。
利福昔明、甲硝唑等窄譜抗生素可針對性清除過度繁殖的致病菌。該方案適用于細菌過度生長綜合征患者，可能伴隨腹痛及體重下降癥狀。治療期間需監測肝功能避免耐藥性產生。
低聚果糖、菊粉等益生元作為有益菌的營養底物，可促進雙歧桿菌增殖。每日攝入10-15克可改善菌群多樣性，尤其適合長期便秘人群。需逐步增量避免初期產氣加重腹脹。
參苓白術散、補中益氣湯等方劑通過健脾祛濕調節微生態平衡。對抗生素相關性腹瀉效果顯著，常見舌苔厚膩、食欲不振等伴隨癥狀。需辨證施治避免苦寒藥物損傷脾胃。
將健康供體糞便經處理后移植至患者腸道，適用于難治性艱難梭菌感染。該操作需在專業醫療機構進行，可能伴隨短暫發熱反應。移植后需持續補充膳食纖維維持菌群穩定。
日常可增加酸奶、納豆等發酵食品攝入，配合每日30分鐘快走促進腸蠕動。建立規律排便習慣，避免濫用瀉藥。長期使用質子泵抑制劑者需定期評估菌群狀態，出現持續水樣便或血便需及時消化科就診。保持充足睡眠減輕壓力對維持菌群平衡具有積極作用。
