胎兒食道閉鎖可能由遺傳因素、環境致畸物暴露、胚胎發育異常、血管異常、染色體異常等原因引起。
部分胎兒食道閉鎖病例與家族遺傳傾向相關。某些基因突變可能干擾胚胎期前腸分化過程，導致食道與氣管分離異常。這類情況多伴隨其他先天性畸形，需通過基因檢測確認。
妊娠早期接觸酒精、香煙、抗癲癇藥物等致畸物質可能破壞食道發育。這些物質通過干擾細胞遷移和管腔形成過程，造成食道中段或遠端閉鎖，常合并心臟或肛門直腸畸形。
胚胎第4-6周前腸分化障礙是主要機制。氣管食管隔發育不全導致兩者未能完全分離，形成盲端型閉鎖。此類情況多表現為Ⅲ型食道閉鎖，占臨床病例70%以上。
食道局部缺血與血管發育缺陷相關。胚胎期食道血供不足可能導致局部組織壞死吸收，形成閉鎖段。這種情況常伴隨食管氣管瘺，需通過超聲檢查評估血管走行。
18三體綜合征、21三體綜合征等染色體疾病可能干擾食道形成。這類病例多合并多發畸形，產前超聲可見羊水過多、胃泡消失等特征性表現，需進行羊水穿刺確診。
孕婦應保證均衡營養攝入，重點補充葉酸和維生素B族以降低畸形風險。避免接觸輻射源和化學污染物，定期進行產前超聲篩查。妊娠期適當進行低強度有氧運動如散步、孕婦瑜伽，有助于改善胎盤血流。發現異常需及時轉診至胎兒醫學中心進行多學科評估，出生后需新生兒外科團隊實施食道重建手術。
