肛門閉鎖手術后肛門功能接近正常，但可能存在排便控制力差異、瘢痕形成等結構性改變。

術后肛門通過重建直腸肛管結構恢復排便通道，多數患者可自主控制排便。先天性肛門閉鎖患兒術后需長期隨訪，部分可能出現大便失禁或便秘，與神經肌肉發育程度相關。生物反饋訓練可改善肛門括約肌協調性。

手術形成的肛門缺乏天然肛門的褶皺結構，瘢痕組織可能影響彈性。高位閉鎖患者術后肛門位置較正常偏前，需注意清潔護理。定期擴肛可預防吻合口狹窄。

重建肛門區域觸覺敏感度降低，對便意感知較弱。脊髓栓系綜合征患者可能合并感覺神經異常。日常需建立規律排便習慣，必要時使用開塞露輔助。

術后可能發生肛周感染、瘺管復發或黏膜脫垂。肛門成形術后的吻合口漏發生率為5%-15%。出現發熱、肛門疼痛需及時就醫，嚴重者需二次手術修補。

80%以上患者經規范治療后能正常上學工作。低位閉鎖患者術后功能優于高位型，成年后性功能和生育能力通常不受影響。心理疏導有助于適應術后狀態。

術后飲食需增加膳食纖維攝入，如燕麥、火龍果、西芹等，每日飲水量不低于1500ml。避免劇烈運動造成肛門壓力驟增，可進行凱格爾運動增強盆底肌力量。便后使用溫水清洗，肛周涂抹凡士林保護皮膚。定期復查肛門直腸測壓和超聲，監測排便功能恢復情況。