食物不耐受可能隨著時間推移自行緩解，但并非所有情況都能完全自愈。食物不耐受與免疫系統無關，通常由消化酶缺乏或腸道敏感引起，部分人群通過調整飲食結構和改善腸道環境可逐漸恢復耐受性。
一、可能自愈的情況：
乳糖不耐受是典型可能改善的類型。部分輕度乳糖不耐受者通過逐步增加乳制品攝入量，刺激腸道產生少量乳糖酶，可能提升耐受能力。發酵乳制品如酸奶中的活性菌群也有助于分解乳糖，減輕腹脹癥狀。嬰幼兒期出現的食物不耐受隨消化系統發育成熟，部分案例顯示3-5歲后癥狀自然消失。
二、難以自愈的情況：
遺傳性果糖不耐受等代謝障礙類疾病通常無法自行恢復，這類患者缺乏醛縮酶B導致果糖代謝異常，需終身避免含果糖食物。麩質不耐受若伴隨腸道絨毛損傷，即使嚴格無麩質飲食后癥狀緩解，重新攝入仍會觸發反應。慢性腸易激綜合征相關的多食物不耐受，常需長期管理而非依賴自愈。
建立飲食日記記錄反應食物，采用低FODMAP飲食法階段性排除高發敏食物，配合益生菌調節腸道菌群平衡，有助于改善功能性不耐受癥狀。規律進食富含膳食纖維的燕麥、南瓜等食物維護腸道屏障功能，避免過度加工食品減少腸道刺激。適度進行慢跑、游泳等低強度運動可促進消化蠕動，但需注意運動后不宜立即進食易致敏食物。若癥狀持續加重或伴隨體重下降，需進行呼氣試驗或血液檢測明確病因。
