蘋果酸奈諾沙星膠囊可通過口服給藥方式治療敏感菌引起的感染，用藥需遵醫囑完成完整療程。
為減少胃腸道刺激，建議在餐后30分鐘內服用該藥物。食物可延緩藥物吸收但不影響總吸收量，高脂飲食可能使血藥濃度峰值降低約20%。每日固定時間服藥有助于維持穩定的血藥濃度。
成人常規劑量為每日400-800mg，分1-2次服用。復雜性皮膚感染每日800mg分兩次服，社區獲得性肺炎每日400mg單次服。肝腎功能不全者需調整劑量，肌酐清除率30-50ml/min時減量50%。
治療周期根據感染類型而定，單純性尿路感染3日療程，肺炎需7-14日。即使癥狀緩解也應完成全程治療，過早停藥易導致細菌耐藥。用藥超過兩周需監測肝功能指標。
18歲以下患者、妊娠期婦女禁用該藥。有肌腱炎病史者慎用，用藥期間避免劇烈運動。與含鎂鋁制劑需間隔2小時服用，與華法林聯用需監測INR值。
常見惡心腹瀉等消化道癥狀，發生率約5%。偶見頭痛失眠等中樞反應，嚴重過敏反應發生率低于0.1%。出現肌腱疼痛或心悸癥狀應立即停藥就醫。
用藥期間每日飲水量保持1500ml以上，避免飲用含咖啡因飲料。建議配合益生菌食品調節腸道菌群，如酸奶、納豆等。治療期間不宜進行高強度運動，適度散步有助于促進血液循環。服藥后出現嚴重腹瀉或皮疹需及時復診，完成治療后建議進行肝功能復查。
