隱形牙套不適合存在嚴重牙周疾病、骨性錯頜畸形、齲齒未治療、依從性差或職業特殊需求的人群。

中重度牙周炎患者牙齦萎縮明顯，牙槽骨吸收嚴重，佩戴隱形牙套可能加速牙齒松動。需先完成牙周基礎治療，待牙周指標穩定后再評估正畸可行性。

下頜前突或后縮等骨性畸形需正頜手術聯合矯正，單純隱形矯治無法改變頜骨位置。這類患者可能出現牙齒移動代償性復發，需通過頭顱側位片明確頜骨發育情況。

未治療的齲齒在封閉的牙套環境中會加速惡化，增加牙髓感染風險。正畸前需完成所有充填治療，對于多顆齲壞患者建議選擇可拆卸的金屬托槽便于清潔。

每日需佩戴20小時以上才能保證療效，兒童或自律性差者易丟失牙套。頻繁摘戴會影響牙齒移動軌跡，導致治療周期延長甚至需要重啟方案。

吹奏類樂手、播音員等職業對發音精度要求高，隱形牙套初期可能影響唇齒音發音。運動員、格斗從業者在訓練中可能因撞擊導致牙套移位或黏膜損傷。

佩戴期間需避免食用染色性強的咖喱、咖啡等食物，每日使用專用泡騰片清潔牙套。配合咬膠訓練增強貼合度，正畸結束后需嚴格佩戴保持器防止反彈。定期口腔檢查可及時發現牙釉質脫礦等并發癥，復雜病例建議選擇傳統托槽與隱形矯治聯合方案。