多數支原體肺炎患者經規范治療后不會遺留后遺癥。該病屬于自限性疾病，肺部病變通常可完全吸收，但免疫功能低下或治療不及時者可能出現支氣管擴張等并發癥。
1、無后遺癥的情況：
典型支原體肺炎患者若早期使用大環內酯類抗生素治療，炎癥反應可在2-4周內消退。兒童患者肺部組織修復能力強，胸部影像學檢查多顯示病灶完全吸收。恢復期建議進行呼吸功能鍛煉如腹式呼吸，每日2次溫水浴有助于促進血液循環，飲食可增加百合、銀耳等潤肺食材。
2、可能出現后遺癥的情況：
合并基礎疾病或延誤治療者，可能遺留持續性咳嗽、運動耐力下降等癥狀。支氣管擴張多與反復感染有關，表現為晨起咳膿痰、活動后氣促。這類患者需定期進行肺功能檢測，避免接觸冷空氣及二手煙，居家可使用空氣加濕器維持50%-60%濕度。中醫調理可選用黃芪、黨參等補益肺氣的中藥材。
康復期間需監測體溫及血氧飽和度三個月，選擇八段錦、太極拳等溫和運動，每周累計運動時間不少于150分鐘。飲食避免辛辣刺激，每日保證15克優質蛋白攝入，如魚肉、豆制品。出現持續低熱或咯血癥狀需及時復查胸部CT，排除肺纖維化等遠期并發癥。保持每日7小時睡眠有助于免疫功能恢復，臥室溫度建議維持在20-24攝氏度。
