畸形精子癥可能影響男性生殖功能，其嚴重程度與精子畸形率、伴隨癥狀及基礎疾病相關。

正常形態精子比例不足30%時，穿透宮頸黏液和卵子透明帶的能力下降。頭部畸形精子難以完成頂體反應，尾部畸形導致運動能力缺陷，二者均影響精卵結合效率。臨床數據顯示重度畸形精子癥患者自然妊娠率僅為正常男性的1/3。

DNA碎片率高的畸形精子可能引發受精卵染色體非整倍體改變。核蛋白異常的精子會增加早期流產風險，研究顯示此類患者配偶的生化妊娠率達28%。部分畸形精子雖能完成受精，但可能造成胚胎停育或胎兒發育異常。

Y染色體微缺失患者的精子常表現為頭頸連接處畸形，這種缺陷可能遺傳給男性后代。線粒體鞘異常的畸形精子存在氧化應激損傷，可能誘發子代線粒體疾病。克氏綜合征患者的圓頭精子癥具有明確的遺傳性特征。

精索靜脈曲張導致的畸形精子癥常伴隨睪丸溫度升高和缺氧，患者多出現會陰墜脹感。慢性前列腺炎引發的畸形精子可見白細胞浸潤，精液培養可檢出大腸桿菌或葡萄球菌。這類患者需同步治療原發感染。

促卵泡激素升高的患者常見精子頂體發育不全，睪酮低下者易見鞭毛結構缺陷。這類患者往往伴隨性欲減退和胡須生長緩慢，實驗室檢查可發現游離睪酮低于8.8nmol/L。

建議患者進行精漿鋅檢測和性激素六項檢查，地中海飲食配合輔酶Q10補充可改善精子膜穩定性。每周3次30分鐘有氧運動有助于提升睪酮水平，嚴重病例需考慮卵胞漿內單精子顯微注射技術輔助生殖。避免高溫環境暴露和電離輻射，戒煙戒酒至少三個月后再復查精液質量。