乙肝疫苗的接種時間需根據年齡和免疫狀態調整，常規接種程序為0-1-6個月三針法，高危人群需加強免疫。
新生兒需在出生后24小時內完成首針接種，體重≥2000g的足月兒按0-1-6個月程序接種。早產兒或低體重兒需待體重達標后開始接種，母親為乙肝表面抗原陽性者需同時注射乙肝免疫球蛋白。
未完成全程接種的兒童需檢測乙肝表面抗體水平，抗體陰性者需補種3針，間隔時間為0-1-6個月。7歲以下兒童補種前無需進行血清學篩查。
成人接種前建議檢測乙肝五項指標，全陰性者需接種3針。醫務人員、血液透析患者等高風險人群接種后需檢測抗體效價，效價不足者需加強免疫。
發生乙肝病毒暴露后需在24小時內接種疫苗，同時注射乙肝免疫球蛋白。完成暴露后預防需按0-1-2-12個月程序接種4針，并定期監測抗體水平。
免疫功能低下者需增加接種劑量或頻次，HIV感染者需檢測CD4細胞計數后接種。慢性肝病患者接種前需評估肝功能，肝硬化患者需采用40μg重組疫苗。
接種后需觀察30分鐘以防過敏反應，接種部位避免抓撓。日常飲食可增加富含維生素A的胡蘿卜、動物肝臟等食物，適當進行游泳、慢跑等有氧運動增強免疫力。完成全程接種1-2個月后應檢測抗體水平，抗體滴度不足10mIU/ml者需重新接種。醫務人員、家庭成員中有乙肝病毒攜帶者等高危人群應每5年復查抗體水平。
