巧克力囊腫子宮內膜異位囊腫的確診需結合臨床癥狀、影像學檢查及病理結果，主要方法包括婦科檢查、超聲檢查、磁共振成像、血清CA125檢測和腹腔鏡檢查。

1、婦科檢查：

醫生通過雙合診或三合診可觸及盆腔內固定、觸痛的包塊，囊腫常位于子宮后方或附件區。典型表現為囊性腫物與子宮粘連、活動度差，月經期壓痛加重。但小型囊腫或深部病灶可能無法觸及，需結合其他檢查。

2、超聲檢查：

經陰道超聲是首選影像學方法，可顯示卵巢內充滿細密點狀回聲的囊性結構，囊壁較厚且與周圍組織分界不清。多普勒超聲可見囊內無血流信號，但周圍卵巢組織血流可能增加。超聲還能評估囊腫大小、位置及對鄰近器官的壓迫情況。

3、磁共振成像：

MRI對深部子宮內膜異位癥診斷價值更高，能清晰顯示囊腫內陳舊性出血的高信號特征。T1加權像呈高信號，T2加權像呈低信號"陰影征"，可鑒別出血性囊腫與其他卵巢腫瘤。MRI還能評估直腸陰道隔、輸尿管等復雜部位的病灶。

4、血清CA125檢測：

約60%患者CA125水平輕度升高通常＜100U/ml，但特異性較低，需排除卵巢癌、盆腔炎等疾病。CA125值與囊腫大小、粘連程度相關，可用于治療后的療效監測，但不能作為獨立診斷依據。

5、腹腔鏡檢查：

作為診斷金標準，可直接觀察盆腔內藍褐色或暗紅色囊腫，囊液呈巧克力樣陳舊血性液體。術中可取活檢進行病理確診，同時評估美國生殖醫學學會ASRM分期。腹腔鏡還能同步進行囊腫剝除、粘連松解等治療操作。

確診后建議保持規律運動如瑜伽、游泳等改善盆腔血液循環，避免劇烈運動引起囊腫破裂。飲食可增加ω-3脂肪酸深海魚、亞麻籽攝入減少炎癥反應，限制紅肉及高糖食物。痛經期間可局部熱敷，每年定期復查超聲監測囊腫變化。若出現急性腹痛、不孕或囊腫直徑超過5厘米，需及時評估手術指征。