黃芪顆粒不適合陰虛火旺者、實熱證患者、孕婦、過敏體質者及外感發熱者使用。
陰虛火旺體質人群表現為潮熱盜汗、口干咽燥、舌紅少苔。黃芪性溫，可能加重體內虛火癥狀。此類人群需選用滋陰降火類中藥，如知柏地黃丸、六味地黃丸。
高熱煩躁、便秘尿赤等實熱癥狀者禁用。黃芪補氣作用可能助熱生火，加重病情。急性炎癥期如牙齦腫痛、瘡瘍腫毒需先清熱，可選用黃連上清片。
孕婦服用可能影響胎兒發育。黃芪活血成分或增加子宮收縮風險，妊娠前三個月尤需謹慎。孕期用藥需遵醫囑，可考慮安全性更高的食補方案。
對豆科植物過敏者可能出現皮疹、呼吸困難等反應。使用前應進行過敏測試，過敏史患者可選用黨參等替代補氣藥材。
感冒發熱期間服用可能閉門留寇，延緩痊愈。需待表證解除后再行補益，發熱期間建議選用金銀花、連翹等解表藥物。
使用黃芪顆粒期間需避免辛辣刺激飲食，適當配合八段錦等溫和運動增強體質。儲存時注意防潮避光，出現不良反應立即停用并就醫。慢性病患者用藥前應咨詢中醫師進行體質辨證，兒童用量需根據體重調整，避免與免疫抑制劑同服。
