腦蛋白水解物可通過改善腦代謝、促進神經修復等方式治療神經功能缺損。使用療程需根據病情嚴重程度、個體恢復差異等因素調整，通常建議2-4周為基礎療程。
1、急性期治療：腦卒中或腦外傷急性期需連續使用14-21天，配合甘露醇脫水、依達拉奉清除自由基等綜合治療。該階段用藥主要針對血腦屏障破壞導致的腦水腫高峰期。
2、恢復期鞏固：后遺癥期建議延長至4-8周，與胞磷膽堿、奧拉西坦等神經營養藥物聯用。臨床數據顯示持續用藥可提升認知功能評分15%-30%。
3、慢性病管理：血管性癡呆患者需每季度進行10-15天脈沖式治療，配合多奈哌齊改善膽堿能傳導。長期間斷使用有助于延緩MMSE量表評分下降速度。
4、兒童應用：腦癱患兒建議分階段使用，每療程20天配合康復訓練，每年重復3-4個療程。需監測血清堿性磷酸酶水平預防骨代謝異常。
5、停藥指征：出現皮疹等過敏反應或肌酐清除率低于30ml/min時應立即停藥。療效評估需結合腦電圖α波恢復程度及日常生活能力改善情況。
治療期間應保持地中海飲食結構，適量補充核桃、深海魚等富含ω-3脂肪酸的食物。每周進行3次有氧運動如快走、游泳，運動時心率控制在220-年齡×60%范圍內。定期復查腦血流灌注顯像評估治療效果，睡眠障礙患者建議聯合重復經顱磁刺激治療。
