灰指甲可通過外用抗真菌藥、口服抗真菌藥、聯合用藥等方式治療，通常由皮膚癬菌感染、甲板損傷、免疫力低下等因素引起。
局部涂抹藥物適用于輕中度感染，常見藥物包括阿莫羅芬搽劑、環吡酮胺乳膏、聯苯芐唑溶液。這類藥物能滲透甲板抑制真菌生長，需持續使用3-6個月直至新甲完全長出。用藥前需銼薄病甲，浸泡后涂抹效果更佳。
嚴重感染需配合口服藥物，常用特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等。特比萘芬對皮膚癬菌殺滅率超過80%，療程通常12周。肝功能異常者需定期監測轉氨酶，妊娠期禁用唑類藥物。
口服與外用藥物聯用可提高治愈率。特比萘芬聯合阿莫羅芬治療中重度灰指甲，真菌學治愈率可達70%-90%。激光治療輔助藥物能增強甲板藥物滲透性，適用于頑固性病例。
感染甲板增厚超過2毫米時需機械減薄，使用尿素軟膏封包48小時軟化后清除病甲。術后暴露甲床涂抹抗真菌藥，避免損傷甲母質導致甲畸形。
治愈后需持續用藥1個月鞏固療效。保持足部干燥，穿吸汗棉襪，避免共用修甲工具。糖尿病患者需嚴格控制血糖，免疫力低下者可預防性使用抗真菌噴霧。
治療期間建議每日用白醋泡腳15分鐘輔助殺菌，補充維生素B族促進甲生長。選擇透氣性好的鞋子，運動后及時更換襪子。若用藥3個月未見新甲生長，需復診調整方案。合并甲溝炎或化膿需配合抗生素治療，嚴重甲毀損可考慮拔甲手術。
