慢性腸胃炎可以通過口服復方谷氨酰胺膠囊、馬來酸曲美布丁、益生菌以及蒙脫石散等進行治療，慢性腸胃炎主要是因為飲食不規律、腹部受涼等因素導致了胃腸道的慢性炎癥性病變，主要表現為大便次數增多、大便稀薄，部分人會有黏液膿血便，以及腹痛腹脹等表現。治療慢性腸胃炎，可以通過口服調節腸道菌群的藥物，比如益生菌和調節腸道功能的藥物，常見的有馬來酸曲美布丁和保護腸道黏膜的藥物，常見的有復方谷氨酰胺膠囊進行治療，對于腹瀉嚴重可以口服蒙脫石散止瀉治療。
如果是因為免疫功能紊亂導致的潰瘍性結腸炎，其主要表現是腹痛腹瀉、黏液膿血便、病情反復發作、遷延不愈，可以通過腸鏡檢查明確診斷。對于潰瘍性結腸炎，需要口服美沙拉嗪以及益生菌等來進行治療。出現慢性腸胃炎，最好是化驗大便常規、做結腸鏡檢查，排除腸道的器質性病變，根據炎癥的具體的情況和相關的臨床表現，有選擇性的采取藥物治療。
