抗病毒藥物根據拮抗的病毒不同，一般分為廣譜抗病毒藥、抗流感病毒藥、抗HIV藥、抗皰疹病毒藥以及抗肝炎病毒藥等幾類。不同種類的疾病應用的抗病毒藥物也不完全一樣：
1、廣譜抗病毒藥：這類藥物的作用通常比較廣泛，可以抑制多種病毒的生長和繁殖。臨床常見的有利巴韋林、干擾素等；
2、抗流感病毒藥：主要針對流感病毒的藥物，常用的有奧司他韋、扎那米韋、帕拉米韋等；
3、抗HIV藥：主要針對HIV病毒的藥物，目前主要有齊多夫定、扎西他濱、司他夫定、拉米夫定、奈韋拉平、去羥肌苷、拉替拉韋、茚地那韋、沙奎那韋、多替拉韋等；
4、抗皰疹病毒藥：針對單純皰疹病毒、水痘-帶狀皰疹病毒的藥物，代表藥物有阿昔洛韋、伐昔洛韋等。針對EB病毒的藥物有干擾素、更昔洛韋等，針對巨細胞病毒的代表藥物有更昔洛韋、膦甲酸等；
5、抗肝炎病毒藥：抗肝炎病毒藥可分為抗乙肝病毒藥和抗丙肝病毒藥。抗乙肝病毒的藥主要有干擾素、恩替卡韋、替諾福韋、丙酚替諾福韋、拉米夫定、替比夫定、阿德福韋酯。抗丙肝病毒的藥主要為索磷布韋維帕他韋、艾爾巴韋格拉瑞韋、雷迪帕韋、索磷布韋、格卡瑞韋哌侖他韋等。
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