生理性卵巢囊腫可以不治療，一段時間后自行消失，針對病理性卵巢囊腫可以通過藥物治療。如果，是由其他因素引起的常見囊腫，則通常無法通過藥物治愈，只有通過手術切除囊腫才能完全治愈。病理性卵巢囊腫進行手術治療。
卵巢囊腫并不少見，一些這種疾病分為生理性和病理性，有些患者很少有癥狀或者無癥狀，疾病的危害可輕可重，不同類型的囊腫，治療辦法也不同，而人們的習慣是，在患病后，第一個想到的治療辦法就是服用藥物。那么，卵巢囊腫吃藥能治好嗎？
卵巢囊腫有三種類型，一種是卵巢漿液性囊腫和粘液性囊腫，另一種是生理性囊腫，包括濾泡性囊腫和黃體囊腫。月經干凈后十天以上，這兩種情況將消失。附件發炎引起的輸卵管卵巢囊腫，直徑小于5厘米的囊腫可以口服藥物治療，服用藥物治療一段時間后，檢查彩超，看囊腫是否變小了。如果變小，可以繼續服用藥物。右腹痛可熱敷，注意觀察，如果腹痛嚴重，則需要去醫院檢查。
卵巢囊腫肯定可以治愈，一些生理性卵巢囊腫，實際上不經治療可以自動消失。
如果是由炎癥刺激引起的炎癥性囊腫，則可以服用抗炎藥進行消炎和止痛治療，并可以達到治愈的目的。如果是由其他因素（例如雌激素和孕激素）引起的常見囊腫，則通常無法通過藥物治愈，只有通過手術切除囊腫才能完全治愈。如果是由子宮內膜異位癥引起的巧克力囊腫，可以通過口服避孕藥來控制囊腫的生長。如果直徑>5cm的卵巢囊腫具有異常的腫瘤標志物，可以通過手術切除進行治療。
正常卵巢功能改變產生的囊腫被稱為生理性囊腫，隨著月經周期的改變而增加或消失。還有一種由卵巢細胞異常增生引起的腫瘤稱為病理性卵巢囊腫，這種腫瘤不會隨著月經周期而消失。生理性卵巢囊腫僅需定期檢查，而無需治療，就會自行消失。因此，這種類型的囊腫服用藥物是沒有意義的。對于生理性卵巢囊腫，需要定期做B超檢查。超聲檢查3個月后，結果提示卵巢囊腫已消失，則可以放心。
